R&D

cours

les professeurs de Sup'Biotech ont adapté leurs cours à la situation. Les outils issus de la biotechnologie  sont en première ligne pour la lutte contre la pandémie.

• De nouvelles techniques de détection utilisant le CRISPR !
  CRISPR est une véritable révolution dans le domaine des biotechnologies. La technique SHERLOCK, décrite en 2017, peut être utilisée pour diagnostiquer Covid-19. Cette technologie est développée pour la société de biotech Sherlock biotechnologies, et est déjà concurrencée par une autre technique, DETECTR, développée pour la société Mammoth Biosciences en 2018.
  Ces stratégies sont décrites par Elise Delage durant le Cours de Biologie Synthétique (Biotech 4).
   

• Implication possible des "radeaux lipidiques" dans le mécanisme d'infection par le SARS-Cov-2
  Ces études très récentes sont destinées à comprendre comment les "lipid rafts" sont utilisés par le virus pour pénétrer dans la cellule. De nouvelles pistes pour tenter de limiter la caractère infectieux du virus !
  Ce mécanisme est étudié durant le cours de biologie cellulaire (Biotech 3)
  
  Pour en savoir plus : Elise DELAGE, Enseignante avec mission de recherche.
   

• Cours de virologie
  Le cours de Virologie dispensé en BT2 s'est forcément facilement prêté au sujet ! Dispensé en janvier par Elodie Layat, elle a pu aborder durant ce cours ce qu'on savait du virus SARS-Cov-2 à l'époque. Cela a été l'occasion d'illustrer, exemple d'actualité à l'appui, la capacité de mutation très élevée des coronavirus.
  
  Pour en savoir plus : Elodie LAYAT, Enseignante permanente.

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• Développer un test COVID-19 par PCR
  Pour introduire les notions de manipulation de séquences génétiques, quel meilleur exemple que le test diagnostic du Covid-19 ?
  Frank Yates, dans son cours "Initiation aux Outils de Génie Génétique" (Biotech 2) aborde cela avec les élèves, qui sont amenés à travailler sur la séquence génomique du virus SARS-Cov2 publiée récemment.
  
  Pour en savoir plus : Frank YATES, Responsable du laboratoire CellTechs

Vidéo ET AUDIO

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• ⭐Historique des premières mesures prises, par Arnaud Fontanet (Institut Pasteur). 20/2/2020. Lien

• De la transmission au mécanisme moléculaire de SARS-Cov-2. Scientific Animations. Lien

• PCR quantitative pour le diagnostic. Arpan Youtube Channel Lien

• ⭐La technique SHERLOCK : Encore une révolution CRISPR. Pour diagnostiquer Covid-19 simplement et rapidement. MIT. 4/12/2018. Lien

• Making vaccines. Sanofi 2018. Lien

• How dangerous is Covid-19 ? SciShow 14/3/20. Link

• Ecouvillonage naso-pharyngé : comment cela se passe-t'il concrétement ? New England Journal of Medicine. 2009. Lien

• Comment le savon détruit le SARS-Cov-2. RCSB Protein Bank. 18/3/2020. Lien

• Décoder les chiffres de l'épidémie. Arte 1/4/20. Lien

• ⭐🆕Comment représenter graphiquement les courbes de nouveaux cas. Minute Physics. 27/3/20. Lien

• "Chronique d'une émergence annoncée" Cours de P Sansonnetti au collège de France. 16/3/20. Lien

• Coronavirus testing. JAMA. 17/4/20. Lien

• List of scientific videos and  talks on Covid19. Center for Infectious diseases. MAJ reg. Lien

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• 🆕 Is the virus SARS-Cov-2 airborne ? Science vs Podcast. 5/4/2020 Link

• ⭐ Plasma transfusion. Radiolab Podcast. 3/4/20. Link

•  The race to make ventilators. Planet Money Podcast. 3/4/20. Link

• 🆕⭐CNRS : La Parole à la Science. Une chaine YouTube du CNRS sur les différents aspects de la crise actuelle. Lien

• Test test Test!  Nature podcast. 17/4/20. Lien

• Coronavirus: can you get it twice ? Science vs. podcast. 17/4/20. Lien

• Was it made in a lab ? Science vs. podcast. 24/4/20. Lien

• List of scientific podcasts  on Covid19. Center for Infectious diseases. MAJ reg. Lien

Comprendre le virus SARS-Cov-2 et la maladie Covid-19

• ⭐🆕En images : Comment le virus agit-il ? Poster multilingue. Azuravesta. Lien

• Introduction Générale sur les coronavirus. Centre for Evidence-Based Medicine, Oxford. 25/3/2020. Lien / Lab Med Blog. 24/2/2020  Lien 

• Revue scientifique référençant les données pathologiques sur la maladie Covid-19  NCBI 20/3/2020. Lien

• Revue scientifique sur le mécanisme d'action des coronavirus. Annual Review of Microbiology 21/6/2019. Lien

• ⭐🆕 Participez à une étude en temps réel de l'INSERM. CovidNet est une initiative du Réseau Sentinelle permettant une étude de l'épidémie à partir des données transmises par des volontaires. Inscrivez-vous ! INSERM- Sorbonne Université - Santé Publique France Lien

•  Covid 19 Insights. Un blog intéressant sur la science du Covid 19. MAJ régulière. Lien

•  Carte de France en temps réel des hospitalisations. Le Monde. MAJ régulière. Lien

• ⭐"How the virus got out". Un excellent article de presse fabuleusement illustré, après une enquête  pour comprendre comment le virus a pu voyager aussi loin, aussi rapidement. New York Times.   Lien

• Articles scientifiques sur la recherche sur Covid-19 : biologie, traitements..... Collection d'articles maintenue à jour par Nature Publishing Group. MAJ régulière. Commentaires et actualité :  lien  / Articles scientifiques : lien

• La carte des initiatives COVID19.
  DGESIP (Ministère de l'Education et de la Recherche). Lien

• Qu'est-ce qu'un respirateur ?
  Traitement privilégié pour les patients graves du Covid-19, cette machine semble est l'élément indispensablepour l'accueil des patients hospitalisés pour troubles pulmonaires. Ce site explique en détail le fonctionnement. 1/4/2020. Lien

• Une maladie aux multiples facettes. Article du Monde. 2/4/20. Lien

• Les pays qui ont aplati la courbe. Le Monde. 27/3/20. Lien

• La pathologie Covid-19 semble être moins sérieuse chez les patients jeunes. Un mystère à résoudre. Ressources sur le Covid-19 et patients pédiatriques. 26/3/2020. Société Française de Pédiatrie. Lien

• Le rôle du pangolin : un voyage aux origines du SARS-CoV-2. Un article bien référencé sur l'origine du virus. Vidal. 3/4/20. Lien

• ⭐Inside the coronavirus genome. Une enquete du New York Times. 6/4/20.Lien

• Coronavirus updates : un site récapitulant de manière originale certains éléments de la crise du Covid. MAJ reg.. Lien

• 🆕 ⭐NEXTSTRAIN : Suivez l'évolution du génome de SARS-Cov-2 en direct ! Un outil visuel excellent qui relie les génomes viraux en fonction de leur similarité et de leur origine de prélévement. Lien

•  🆕Etude scientifique : Quand est-on  infectieux ?
  Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nature Medicine. 15/4/20. Lien  -    Commentaire : ScienceNews Lien  

•  🆕⭐Tous les patients sont-ils guéris définitivement ? Un article très bien sourcé  du New York Times sur cette question importante. 13/4/20. Lien

• Revue scientifique complète : immunité acquise après une infection à Coronavirus. Medrxiv 17/4/20. Lien

• ⭐Comment s'informer ?
  En ces temps incertains, armez-vous de la meilleure des armes : la méthode scientifique, et méfiez-vous des biais cognitifs !  Médecine et niveau de preuve. Lien  / Liste illustrative des biais cognitifs. Link  / Communauté zététique (les geeks de la méthode scientifique) Lien / Comment s'informer : AFIS, liste de Liens

Traitements possibles et essais cliniques (académiques et industriels)

• 🆕⭐ANTICOVID un site recensant toutes les avancées cliniques sur la maladie, avec un outil de recherche excellent. CEPTON strategy. MAJ régulière. Site web : Lien / Recap (6/4/20) PDF

• 469 étudess cliniques à la loupe. Synthèse graphique de tous les essais cliniques publiés sur clinicaltrials.org . Bioweb. 14/4/20. Lien

• Essai clinique DISCOVERY. Un essai clinique européen destiné à évaluer quatre traitements expérimentaux contre le Covid-19 vient de démarrer. INSERM.  24/3/2020. Lien

• Essai clinique SOLIDARITY. Un essai clinique mondial incluant des milliers de patients, coordonnés par l'OMS. Science. 22/3/2020. Lien

• 🆕Coviplasm : un essai français utilisant le plasma de patients guéris.  Sciences et Avenir 6/4/20. Lien

• ⭐La Biotech en Europe se mobilise contre le Covid. Labiotech. 10/3/2020. Lien

• La vaccination à l'aide d'ARN messager : où en est-on? A mRNA Vaccine Overview. Labiotech. 30/3/2020. Lien

• Repositionnement de médicaments : est-ce dans les vieux pots qu'on fait les meilleures soupes ? Enquête sur le "repurposing". ScienceNews 10/3/2020. Lien / Nature Biotechnology. 27/2/2020. Lien

• Développer un médicament en urgence. Comment la situation actuelle peut profondément changer le pipeline du développement clinique. Nature Biotechnology. 20/3/2020. Lien

• Pourquoi est-il si difficile de développer un vaccin rapidement ?
  Ce commentaire dans New England Journal of Medicine explique les défis à relever au cours du développement de médicament. NEJM. 2/4/2020. Lien

• ⭐Que se passe-t'il physiologiquement quand on guérit du Covid-19? Un commentaire très bien référencé pour comprendre comment le système immunitaire réagit après l'infection, et la durée de la protection engendrée. A Christakis. Lien

• 🆕⭐Liste de traitements et vaccins en cours d'essai. FreeThink media 13/4/20. Lien  / The Scientist 7/4/20 Lien

•  🆕Déconfinement : la somme de tous les dangers
  Liste complète des aspects médicaux et sociétaux à prendre en compte, par le Pr. Sansonneti. 13/4/20. Lien

• Les anticorps : quelle protection offrent-ils vraiment ? Pour la Science. 16/4/20. Lien

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Diagnostic / Tests

• ⭐Vue d'ensemble des techniques de tests actuellement utilisés. The Scientist. 3/3/2020. Lien

• Etat du marché diagnostic Covid-19. Commentaire très complet. Nature. 23/3/2020. Biotechnology. Lien

• ⭐Enquête intéressante sur les tests diagnostics et les difficultés rencontrées aux Etats Unis. New Yorker. 20/3/2020. Lien

• Liste à jour des tests commerciaux disponibles pour le Covid-19. 360dx diagnostics. MAJ régulière. Lien

• L'automatisation des tests : un outil clé pour augmenter leur nombre ? Sciences et Avenir. 26/3/2020. Lien

• ⭐Technique de détection SHERLOCK - la biotechnologie d'aujourd'hui et de demain : CRISPR à la rescousse pour diagnostiquer le Covid-19 de manière simple, rapide et efficace. MIT. 14/2/2020   Lien

• NGS (Sequençage Nouvelle Génération) : peut-il être utilisé à des fins de détection diagnostique pour diagnostiquer des milliers de patients à la fois ? Un article en prépublication par H. Sallis (Penn State U). 20/3/2020. Lien

• Nouvelle technique de dépistage isothermique : Le procédé developpé par ALERE (Abbott) est autorisé par la FDA pour Covid-19. ALERE "ID NOW" technology : Lien / FDA emergency use (Abbott)  27/3/2020. Lien

• Sensibilité vs. Spécificité : la base. J. de Vos, tweet. 18/4/20. Lien

• Pourquoi un test fiable à 95% n'est pas si bon que ça. Thread de Z. Binney. 2/4/20 Lien

• Comparaison systématique des kits diagnostics :Covidtestingproject. Lien

RESSOURCES BIBLIOGRAPHIQUES

• 🆕⭐ Resources institutionnelles dédiées au COVID-19 (mises à jour régulièrement)

  • CNRS "Coronavirus sur le front scientifique" Lien

  • AFSP (Association Française de Science Politique) "COVID-19, une pandémie sous le regard de la science politique et des sciences sociales" Lien
     

• 🆕 Sites recensant les derniers articles scientifiques sur le Covid-19 :

  • BMJ

  • Cambridge University Press

  • Centers for Disease Control and Prevention

  • CERAH

  • ⭐ Cochrane

  • Elsevier

  • European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC)

  • JAMA Network

  • The Lancet

  • New England Journal of Medicine

  • Nuffield Council on Bioethics

  • Oxford University Press

  • PLOS

  • Springer Nature

  • Wiley

  • WHO

  • SSRN et ⭐ BioRxiv Sites de pré-publication (preprints : articles non peer-reviewés) :

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• 🆕 Editeurs offrant des accès gratuits ou privilégiés à leur ressources (d'ordinaire payantes). Source : Cécile Vermot

  • American Society for Microbiology : accès gratuit aux articles COVID-19

  • Annual Review : accès libre jusqu’au 30 avril 2020 à tout le catalogue

  • BioOne : articles liés au coronavirus

  • Brill : ouverture d'une collection spéciale  : 

  • British Medical Journal : accès libre aux dossiers "COVID-19" 

  • Cairn

  • Cell Press : sélection de ressources ouvertes en libre-accès 

  • Duke University Press : sélection d'ouvrages, d'articles, livres (jusqu'au1/10) 

  • Elsevier-Masson : contenus sont disponibles gratuitement 

  • EDP Sciences : accès gratuit, (dont ⭐Médecine-Sciences ! )

  • ERUDIT : contenus diffusés sont disponibles gratuitement

  • JAMA- Journal of American Medical Association : accès à la COVID-19 Collection

  • John Libbey: revues en accès gratuit (en cours)

  • ⭐ JoVE : Journal of Visualized Experiments : accès gratuit à Jove Ed (jusqu'au 15/6)

  • JStor :  Accès gratuit pour tous aux archives de 29 revues en santé (jusqu'au 30/6)

  • Microbiology Society : sélection d'articles sur le sujet

  • MIT : accès pour les bibliothèques à près de 2700 ebooks (jusqu'à fin mai - en cours)

  • NEJM - New England Journal of Medicine : collection d'articles

  • Numérique Premium: ouvre  sa plateforme (jusqu'au 15 avril) (en cours)

  • The Royal Society et le Welcome Trust : partage des données de recherche 

  • Science - AAAS : sélection sur le Coronavirus et dernières infos en accès libre 

  • Springer-Nature : articles de recherche sur le Coronavirus 

  • Taylor & Francis : toutes les publications sur le Covid-19 

  • Wiley : accès gratuit à plus de 5000 articles liés au COVID-19 

  • Web of Science : guides, dont le Cortellis Drug Discovery Intelligence (sur demande).

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Conferences En ligne
De nombreuses conférences sont proposées en ligne durant le confinement. N'hésitez pas à y assister !
Si vous entendez parler d'une conference, Prévenez-nous!

🎤 WEBINARS EN LIVE

Calendrier complet : consultez l'agenda SBRD
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• Notre sélection :
  • Novartis : mRNA vaccines. 23/4/20. Lien
  • Harvard : Ethics of organoid Research. P. Arlotta. 7/5/20. Lien
  • ⭐MEDICEN : 4 entreprises engagées dans la lutte contre le Covid-19. 17/4/20.
    Le pôle Medicen Paris Region souhaite mettre en avant ses adhérents qui proposent des solutions d'ores et déjà utilisables pour lutter contre le Covid-19. Chaque entreprise se présentera en 5 minutes, suivi de questions. Inscription
     

  • ⭐Webinars sur la microscopie et l'imagerie. Organisé par RTMFM/CNRS. Lien

    • 10 avril à 11h, Aurélien Dauphin, Institut Curie. Mettre en place la Microscopie SRRF chez vous. Inscription

    • 14 avril à 11h, Sophie Abélanet, IPMC Sophia-Antipolis, 

    • 17 avril à 11h, JérômeMutterer, IBMP Strasbourg, Arduino et approfondissement

    • 20 avril à 11h, Matthieu Ducros, Bordeaux Neurocampus, Latticelightsheet Home Made

    • 24 avril à 11h, HishamForrière, Bordeaux Neurocampus, Avancées technologiques en Lightsheet
       

  • International Genetic TAGC Conference. 22-24/4/20
    Une des premières conférences internationales complètement passée en webinar ! Orgaisé par le Genetic Society of America. Inscription gratuite
     

  • 🆕⭐Colloque Evry-Bio : les biotechnologies d'aujourd'hui
    Au programme : Microbiote, impression d'organes, bactériophages...
    Organisé par les élèves de L3 Evry. 20-24/4/20  Inscription : Lien
     

  • Séminaire Covid19 organisé par le CESP : Retour d'expérience clinique, rôle de l'intelligence artificielle, initiatives en cours... 17/4/20 à 9h
    Une conférence passionante organisée par le Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations . Contact : Cécile Vermot.
    Programme : Lien   / Inscription gratuite : Lien
     

  • 🆕⭐Un institut de recherche au coeur de la lutte. Conference donnée par le CIBU (Pasteur, Paris). 23/4/20 14h00 . Inscription
    Conférence réservée aux étudiants Sup'Biotech.
     

  • 🆕⭐Académie des sciences : 10 minutes. Conference donnée par des intervenants exceptionnels. 7/5/20 16h00 Lien
    
     

📼 WEBINARS ENREGISTRES

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• Centre de recherche en Epidémiologie et Santé des Populations
  Le CESP (Inserm - Paris - Paris Saclay) organise un webinaire le1er avril qui porte notamment sur les aspects sciences humaines et sociales de l'épidémie. Programme : lien  /  Vidéos en ligne : Lien
   

• Le collège de France met des milliers de cours en ligne. Lien
   
• Liste de séminaires collectés par la SFBD. Lien
   
• A virtual conference on IPS and organoids.
  Many videos, talks, posters... (Stem Cell Technologies) . Lien
   
• Organoids, iPSCs, and advanced cell models, Wed Apr 1st, 6pm Paris time
  Webinar on Advancing discovery from basic research to drug discovery. (Science) Lien
   
• The living brain project : preventing dementia
  On demand webinar. (Gen Eng) Lien
   
• Clinical grade production
  List of on demand webinars (by EMDMillipore). Lien
   
• ⭐Stem Cell webinars
  List of on demand webinars by Takara. Lien
   
• Three-dimensional Models for Oncology and Retinal Research
  By Corning and Univ Amsterdam. On demand. Lien
   
• 🆕MEDICEN : 4 entreprises engagées dans la lutte contre le Covid-19.
  Enregistrement du 10/4/20: lien
   
• 🆕 ⭐MOOC "Emerging viruses"
  Institut Pasteur. Plateforme FUN. Inscription jusqu'au 10/4/2020 Lien